Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 CCDC107-206ENST00000426546 1242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 NBPF9-209ENST00000621645 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 WISP2-201ENST00000190983 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 NUBP2-201ENST00000262302 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ID1-201ENST00000376105 1233 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 CAMKK2-207ENST00000404169 2116 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 AC022167.3-201ENST00000564485 427 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 NOC2LP2-201ENST00000407594 1944 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 TMEM25-203ENST00000354284 1456 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 HS3ST3A1-201ENST00000284110 2527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 RTBDN-202ENST00000393233 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ADGRD1-AS1-202ENST00000542980 1277 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 DCST1-204ENST00000423025 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 CMTM7-202ENST00000349718 1214 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 PSMG1-202ENST00000380900 907 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
ATL3Q6DD88 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 COX7A1-201ENST00000292907 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
ATL3Q6DD88 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms