Protein–RNA interactions for Protein: Q5VXU9

C9orf84, Uncharacterized protein C9orf84, humanhuman

Predictions only

Length 1,444 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf84Q5VXU9 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 LHX3-202ENST00000371748 2365 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 DCK-201ENST00000286648 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 TSPY2-201ENST00000320701 1161 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 TSPY2-203ENST00000429039 779 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 LITAF-220ENST00000620789 692 ntTSL 5 BASIC28.35■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 AC233702.3-201ENST00000578656 1387 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 SENP5-204ENST00000445299 2491 ntTSL 2 BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 TAF15-215ENST00000605844 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
C9orf84Q5VXU9 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 HEY2-201ENST00000368364 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 CDK4-202ENST00000312990 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 DISC1-213ENST00000537876 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 RBM45-207ENST00000616198 1788 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 POMGNT1-201ENST00000371984 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 ATMIN-201ENST00000299575 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
C9orf84Q5VXU9 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.5 ms