Protein–RNA interactions for Protein: Q5VUJ6

LRCH2, Leucine-rich repeat and calponin homology domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 765 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRCH2Q5VUJ6 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 OBSL1-204ENST00000404537 5841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 CFL1-201ENST00000308162 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 PITPNB-211ENST00000634017 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 IRF5-202ENST00000357234 1680 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 DGCR6L-201ENST00000248879 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 MCCD1P1-208ENST00000445732 328 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AP006621.4-201ENST00000527021 532 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 KCNS2-201ENST00000287042 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 UBP1-202ENST00000283629 4148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AC073107.1-201ENST00000633579 1962 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 MBD3-207ENST00000590550 2782 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 AC126696.3-202ENST00000570159 553 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 RBM42-202ENST00000586618 771 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
LRCH2Q5VUJ6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms