Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTT2

C9orf135, Protein C9orf135, humanhuman

Predictions only

Length 229 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C9orf135Q5VTT2 TRAPPC3-204ENST00000373166 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CRAT-202ENST00000393384 973 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TRPT1-203ENST00000394547 865 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CT47A1-201ENST00000433030 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AL590627.2-201ENST00000637510 144 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
C9orf135Q5VTT2 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SPSB1-201ENST00000328089 3120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 TFDP2-202ENST00000467072 1853 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 INSM2-201ENST00000307169 3013 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ATP2A2-201ENST00000308664 4453 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CYP2F1-201ENST00000331105 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 DENND2A-201ENST00000275884 3735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CHRM4-201ENST00000433765 1511 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SIM2-201ENST00000290399 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 METRN-204ENST00000568223 3325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CCR12P-201ENST00000446203 998 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 MAP4K4-202ENST00000324219 7526 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 KCTD20-210ENST00000536244 5345 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 PLA2R1-202ENST00000392771 5160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SEPT11-201ENST00000264893 5593 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SNX19-209ENST00000530356 1562 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 PSMG4-209ENST00000473000 4603 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CRYZL1-203ENST00000381540 1482 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 PLPP2-201ENST00000269812 1228 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AIF1L-203ENST00000372298 849 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AC002094.1-201ENST00000591482 1050 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
C9orf135Q5VTT2 AC145285.6-201ENST00000604632 637 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms