Protein–RNA interactions for Protein: Q5VTD9

GFI1B, Zinc finger protein Gfi-1b, humanhuman

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Length 330 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GFI1BQ5VTD9 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC14.77□□□□□ -0.04
GFI1BQ5VTD9 FTCDNL1-202ENST00000420128 1021 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 APTR-203ENST00000430801 583 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CD99P1-203ENST00000431582 602 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 MMP25-AS1-204ENST00000572574 794 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 AC022517.1-201ENST00000592429 346 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 MAP3K6-202ENST00000374040 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 LMAN1L-202ENST00000379709 1699 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 FOXN3-209ENST00000555353 1595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CYP2W1-201ENST00000308919 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 SH3BP5-206ENST00000426925 2190 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 MTHFS-201ENST00000258874 907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ZNF644-203ENST00000361321 1253 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CTNNAL1-202ENST00000374593 761 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 STAG3L3-201ENST00000423834 1262 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 MYO19-221ENST00000620640 1186 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CIRBP-246ENST00000628979 1043 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ST3GAL3-239ENST00000545417 1667 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 GLT8D1-213ENST00000491606 1577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ENTPD2-201ENST00000312665 1500 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 WISP2-202ENST00000372865 1518 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
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GFI1BQ5VTD9 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 KRT19-201ENST00000361566 1390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GFI1BQ5VTD9 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 RASGRP2-206ENST00000377494 2983 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 GDF15-201ENST00000252809 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CFD-201ENST00000327726 1201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 VSX1-201ENST00000376707 943 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GFI1BQ5VTD9 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 VSX1-206ENST00000444511 1197 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 HMX1-202ENST00000506970 651 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 TRIM35-203ENST00000521253 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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GFI1BQ5VTD9 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 DIRC2-201ENST00000261038 3596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 FUZ-212ENST00000528094 1479 ntTSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 PNLIPRP2-204ENST00000591655 1456 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 SMARCC2-201ENST00000267064 4076 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 ADAM11-203ENST00000535346 2529 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 CD37-204ENST00000535669 1674 ntTSL 2 BASIC14.74□□□□□ -0.05
GFI1BQ5VTD9 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
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