Protein–RNA interactions for Protein: Q5T3J3

LRIF1, Ligand-dependent nuclear receptor-interacting factor 1, humanhuman

Predictions only

Length 769 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIF1Q5T3J3 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 MTDHP1-201ENST00000605323 784 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 AC005332.8-201ENST00000622750 2735 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 POU5F1-201ENST00000259915 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 CACNA1B-203ENST00000371355 9647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 CCT4-204ENST00000544079 2261 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 CDKN2B-AS1-217ENST00000585267 1337 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 MAGI2-AS3-202ENST00000422093 762 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 AC022211.2-202ENST00000582668 546 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 PCCA-202ENST00000376285 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 FAM222A-202ENST00000538780 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 GBGT1-203ENST00000372040 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 GOLGA3-203ENST00000456883 5496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 STOML1-209ENST00000564777 1849 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 AC092171.1-201ENST00000455866 753 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 AC104771.1-201ENST00000603335 964 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 MBD1-206ENST00000382948 2434 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 C2orf82-203ENST00000409533 561 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
LRIF1Q5T3J3 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIF1Q5T3J3 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIF1Q5T3J3 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIF1Q5T3J3 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIF1Q5T3J3 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIF1Q5T3J3 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIF1Q5T3J3 MZF1-206ENST00000599369 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIF1Q5T3J3 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
LRIF1Q5T3J3 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIF1Q5T3J3 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIF1Q5T3J3 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
LRIF1Q5T3J3 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.5 ms