Protein–RNA interactions for Protein: Q5SRH9

TTC39A, Tetratricopeptide repeat protein 39A, humanhuman

Predictions only

Length 613 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TTC39AQ5SRH9 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 MED15P9-202ENST00000427638 1841 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 GALNT13-201ENST00000392825 5536 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 NAT8L-201ENST00000331662 5571 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 ULK4P3-205ENST00000568486 1158 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 ST6GALNAC4-201ENST00000335791 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AC008556.1-201ENST00000610908 2040 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 RREB1-203ENST00000379933 5826 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 FGFR2-204ENST00000356226 3547 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AC074183.1-201ENST00000439105 782 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TTC39AQ5SRH9 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.5 ms