Protein–RNA interactions for Protein: Q5BJE1

CCDC178, Coiled-coil domain-containing protein 178, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC178Q5BJE1 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 AGFG2-201ENST00000300176 4796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 SLC47A1-202ENST00000395585 1998 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 OLFM1-205ENST00000371796 2492 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 GALNT10-201ENST00000297107 5961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
CCDC178Q5BJE1 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 FOXD2-201ENST00000334793 4675 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 NDUFA12-201ENST00000327772 635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 MYH14-208ENST00000598205 6137 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 PDE4DIP-214ENST00000479408 2746 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 KLF13-201ENST00000307145 6825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 MAP3K14-AS1-202ENST00000585351 893 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 RABAC1-210ENST00000601891 628 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
CCDC178Q5BJE1 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms