Protein–RNA interactions for Protein: Q587J8

KHDC3L, KHDC3-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KHDC3LQ587J8 PRSS22-203ENST00000571228 1037 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 JOSD2-205ENST00000601423 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 AL138963.3-201ENST00000610057 588 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 AL831711.1-201ENST00000636824 569 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 CXADR-201ENST00000284878 6254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 DUSP4-201ENST00000240100 5537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 ZNF746-202ENST00000458143 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 ITGA8-201ENST00000378076 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 RAB43-201ENST00000315150 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 KLHDC4-201ENST00000270583 1886 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 VSTM2B-201ENST00000335523 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 STRN4-201ENST00000263280 3210 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 WDR37-203ENST00000381329 1307 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 C1QTNF5-203ENST00000530681 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 FZR1-203ENST00000441788 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 IQSEC2-202ENST00000396435 6015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 DAGLB-204ENST00000436575 2385 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 NADSYN1-201ENST00000319023 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 EFCAB11-202ENST00000538485 1870 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 CENPH-206ENST00000515001 1305 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 BRI3-207ENST00000539286 699 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC15.02■□□□□ -0
KHDC3LQ587J8 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 AC134043.2-201ENST00000624206 2238 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 ZNF815P-204ENST00000434898 1737 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 C3orf18-201ENST00000357203 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MAGI1-213ENST00000483466 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 CELF3-201ENST00000290583 3246 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PDLIM2-205ENST00000397761 1491 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
KHDC3LQ587J8 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms