Protein–RNA interactions for Protein: Q587J7

TDRD12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,177 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TDRD12Q587J7 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ELAC1-203ENST00000588577 694 ntTSL 2 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SCARF1-202ENST00000348987 2619 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ARRB2-216ENST00000574954 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC20.43■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 C6orf48-205ENST00000375640 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ZNF295-AS1-201ENST00000412906 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 CTSB-202ENST00000353047 3875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 CHST11-205ENST00000549260 5696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 CDC42EP2-201ENST00000279249 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AC011416.4-201ENST00000639283 2195 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 EWSR1-207ENST00000406548 2207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PCOLCE-AS1-201ENST00000442166 2537 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 C10orf91-201ENST00000321248 1257 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 DYNLT3-203ENST00000432389 719 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 RNASEK-202ENST00000548577 810 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ZNF264-205ENST00000599653 705 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 MAGIX-206ENST00000615626 1057 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 IL15RA-222ENST00000622442 1160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AC013268.1-201ENST00000639717 1208 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AP001626.1-201ENST00000424890 2854 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 KRT13-202ENST00000336861 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PRR14-202ENST00000300835 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC20.41■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 KLHL31-201ENST00000370905 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 MEA1-201ENST00000244711 1089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 FST-201ENST00000256759 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PSPC1-201ENST00000338910 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 GAS7-202ENST00000396115 929 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AP003097.1-201ENST00000530657 1135 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 CMTM3-211ENST00000565922 615 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SAMD11-216ENST00000620200 1874 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC20.39■□□□□ 0.86
TDRD12Q587J7 ADAMTS7-201ENST00000388820 5490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
TDRD12Q587J7 DUSP23-201ENST00000368107 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms