Protein–RNA interactions for Protein: Q56NI9

ESCO2, N-acetyltransferase ESCO2, humanhuman

Predictions only

Length 601 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ESCO2Q56NI9 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 ETV7-203ENST00000373737 1488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 WDR25-201ENST00000335290 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 ASPHD1-201ENST00000308748 1584 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 IL11RA-201ENST00000318041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 ZNF821-211ENST00000564134 1748 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 MAP2K5-203ENST00000354498 1783 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 MAPKAPK3-201ENST00000357955 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 PHF20L1-214ENST00000485595 1810 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 DDX42-216ENST00000583590 4148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 SPDYE2-201ENST00000341656 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 ISG20-202ENST00000379224 540 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 SPDYE2B-202ENST00000455020 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 EPHA5-AS1-202ENST00000509473 1177 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 BAALC-AS1-206ENST00000521383 736 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 AL023875.1-201ENST00000640777 796 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 ETV2-202ENST00000379026 1571 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 MSL1-202ENST00000398532 4707 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 ACY1-215ENST00000636358 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 TP73-AS1-203ENST00000423764 2875 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 ELN-207ENST00000380562 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 TRIM33-201ENST00000358465 8339 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 PCSK5-201ENST00000376752 5756 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.25
ESCO2Q56NI9 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 DNTTIP1-201ENST00000372622 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 RHOD-202ENST00000532559 538 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SPIB-206ENST00000596074 847 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 MRGPRE-201ENST00000389832 1409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 KRT8P17-201ENST00000453110 1448 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 PDLIM2-207ENST00000409417 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 NTSR2-201ENST00000306928 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 NSDHL-201ENST00000370274 1929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 MIXL1-201ENST00000366810 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 AC046158.3-201ENST00000624947 2558 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 AL391005.1-201ENST00000623953 2435 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 PTPN5-202ENST00000396166 2299 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 TDP2-202ENST00000378198 2071 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 DBNL-207ENST00000440166 1415 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 MME-217ENST00000616757 1315 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 MIR718-201ENST00000390190 70 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 GPR35-203ENST00000407714 1258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 AL162258.1-201ENST00000497086 753 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 SFXN1-203ENST00000502393 637 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 THAP6-213ENST00000514480 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 CA3-AS1-201ENST00000517697 559 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
ESCO2Q56NI9 AC091564.5-201ENST00000526456 820 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.2 ms