Protein–RNA interactions for Protein: Q53HL2

CDCA8, Borealin, humanhuman

Predictions only

Length 280 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDCA8Q53HL2 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC26.01■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ZMYM5-202ENST00000382905 1382 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 PEX11G-201ENST00000221480 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AC064834.1-201ENST00000606986 503 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 DNAJB6-218ENST00000634080 1005 ntTSL 2 BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ARMC9-201ENST00000349938 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 CACTIN-202ENST00000248420 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ICA1-208ENST00000407906 1615 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 DMKN-208ENST00000424570 1293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AZIN1-AS1-214ENST00000522850 473 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 UBA52-210ENST00000598780 668 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 HCN1-202ENST00000634658 4738 ntTSL 3 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 KRT18P35-201ENST00000510488 1269 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 CD81-212ENST00000526072 1172 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.98■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 CHTOP-202ENST00000368687 1094 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 ELAC2-212ENST00000578071 579 ntTSL 4 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC25.97■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
CDCA8Q53HL2 KCNK6-201ENST00000263372 5722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.5 ms