Protein–RNA interactions for Protein: Q32MZ4

LRRFIP1, Leucine-rich repeat flightless-interacting protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 808 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRRFIP1Q32MZ4 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 PMEPA1-202ENST00000341744 4845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 IL17RE-206ENST00000454190 2757 ntTSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 DAG1-221ENST00000541308 5676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 USP21-201ENST00000289865 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 SLMAP-201ENST00000295951 5433 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 ZIC1-201ENST00000282928 5241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 PITX2-203ENST00000355080 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 UNC5B-AS1-201ENST00000447119 647 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC008622.2-201ENST00000617006 1229 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 FP565260.3-205ENST00000620481 816 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 OSTM1-201ENST00000193322 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 SAMD11-213ENST00000618181 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 BX323043.1-201ENST00000641006 1765 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC100793.2-201ENST00000593139 542 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 CYSTM1-201ENST00000261811 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 SLC35A3-224ENST00000640732 1777 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 FBXL19-207ENST00000565690 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 RBL2-201ENST00000262133 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC004448.5-201ENST00000579897 567 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AL158151.3-201ENST00000599172 696 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC005363.2-201ENST00000618631 242 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 RGMB-207ENST00000513185 2052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 GIT1-201ENST00000225394 3768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 CAMKK1-202ENST00000348335 3563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 LRRC23-202ENST00000323702 1208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC215522.2-202ENST00000633163 1143 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
LRRFIP1Q32MZ4 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms