Protein–RNA interactions for Protein: Q2KHR2

RFX7, DNA-binding protein RFX7, humanhuman

Predictions only

Length 1,363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RFX7Q2KHR2 RAP1B-229ENST00000543393 874 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AL512604.3-201ENST00000569583 964 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 TMEM259-209ENST00000592590 2509 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 C21orf91-202ENST00000400558 1090 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 UMOD-203ENST00000396138 2399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 PAXIP1-202ENST00000404141 3827 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 VLDLR-AS1-205ENST00000599229 1346 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 MOXD1-203ENST00000392401 2191 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 COLCA2-201ENST00000398035 1414 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 HOMER2P1-201ENST00000455653 964 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 SURF4-206ENST00000485435 1206 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 AL121956.5-201ENST00000625261 221 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
RFX7Q2KHR2 NPM3-201ENST00000370110 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 COPS8-203ENST00000409334 794 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
RFX7Q2KHR2 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.1 ms