Protein–RNA interactions for Protein: Q17RS7

GEN1, Flap endonuclease GEN homolog 1, humanhuman

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Length 908 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GEN1Q17RS7 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 CCDC151-201ENST00000356392 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AC008691.1-203ENST00000515337 1580 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 SDHA-201ENST00000264932 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ASPM-201ENST00000294732 6132 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ACAA1-201ENST00000301810 1540 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 FOXC2-201ENST00000320354 2478 ntAPPRIS P1 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 CA11-201ENST00000084798 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 FGFR1-206ENST00000397091 5702 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 MRM1-204ENST00000614766 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 SUSD3-205ENST00000617293 1076 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 SLC22A17-211ENST00000637426 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 GABRD-201ENST00000378585 1961 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 TUBA8-201ENST00000316027 1518 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 MSANTD2-202ENST00000374979 2349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 CELF6-202ENST00000395258 1741 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 PCDHB11-202ENST00000624887 1973 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 LRP8-204ENST00000371454 3322 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 FAHD2CP-202ENST00000443258 893 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ST20-202ENST00000485386 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 KANSL1-AS1-203ENST00000572973 424 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AC009542.2-201ENST00000637483 1189 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 KRT1-201ENST00000252244 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 PCMT1-203ENST00000367384 1938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 GAL3ST1-206ENST00000406955 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 TAF4B-201ENST00000269142 5260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 IL17RC-203ENST00000403601 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 SCGB3A1-201ENST00000292641 521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 AL513320.1-201ENST00000435049 622 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 ACTL6A-201ENST00000392662 1899 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
GEN1Q17RS7 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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