Protein–RNA interactions for Protein: Q16831

UPP1, Uridine phosphorylase 1, humanhuman

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UPP1Q16831 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
UPP1Q16831 FER1L4-211ENST00000616283 1818 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 MATN4-202ENST00000360607 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 STIM2-211ENST00000639195 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 AKIRIN1-201ENST00000372984 1330 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 PDZD7-203ENST00000470414 1057 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 FXYD7-203ENST00000586063 456 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 FXN-203ENST00000396366 922 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 FHL1-219ENST00000618438 2178 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 AL807752.6-202ENST00000622933 765 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 FAM46B-201ENST00000289166 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 LAG3-201ENST00000203629 1974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 PDLIM7-205ENST00000393551 1226 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 KLHL21-204ENST00000467612 1056 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 NOP14-AS1-202ENST00000505731 1999 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 RASSF1-201ENST00000327761 1757 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
UPP1Q16831 RPA2-201ENST00000313433 1237 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46 ms