Protein–RNA interactions for Protein: Q16667

CDKN3, Cyclin-dependent kinase inhibitor 3, humanhuman

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Length 212 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDKN3Q16667 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 EEF2KMT-206ENST00000587133 873 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 SLC31A2-201ENST00000259392 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 PGAP3-206ENST00000579146 2220 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 USP36-203ENST00000542802 6063 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 MORC4-201ENST00000255495 2940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CCK-202ENST00000396169 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CTBP2-214ENST00000531469 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 GUK1-204ENST00000366721 689 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 ADORA1-208ENST00000618295 862 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 FBXL22-204ENST00000638704 729 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 MRPL52-201ENST00000311892 1042 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AC063952.2-201ENST00000498792 1227 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 LINC01238-205ENST00000567549 1107 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 TXNL4A-211ENST00000592837 611 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AC022154.1-201ENST00000600303 766 ntTSL 3 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 EWSR1-208ENST00000414183 2189 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 DNAJC28-201ENST00000314399 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 SPATA6L-207ENST00000475086 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 STX5-202ENST00000377897 1785 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 MED25-212ENST00000618715 1467 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 HDAC11-AS1-201ENST00000424112 515 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC18.79■□□□□ 0.6
CDKN3Q16667 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
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