Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AQP4-AS1-204ENST00000582605 525 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 PLEKHG5-206ENST00000377748 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CRYBB2P1-202ENST00000382734 1364 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 PIK3R1-201ENST00000320694 2625 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 BHLHE22-201ENST00000321870 3262 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 HSCB-201ENST00000216027 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 EIF2AK4-209ENST00000560648 687 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CD177-203ENST00000618265 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ITGA6-201ENST00000264107 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 ARMC6-202ENST00000392335 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
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ZNF239Q16600 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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ZNF239Q16600 DACT2-204ENST00000610183 2088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
ZNF239Q16600 NRG2-202ENST00000289422 2923 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 GPR42-201ENST00000454971 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 NGLY1-202ENST00000280700 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 ATIC-205ENST00000435675 2275 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 TMEM8A-204ENST00000431232 3691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 CELF2-217ENST00000638035 1849 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
ZNF239Q16600 GAS6-201ENST00000327773 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
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