Protein–RNA interactions for Protein: Q16576

RBBP7, Histone-binding protein RBBP7, humanhuman

Predictions only

Length 425 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP7Q16576 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 ZNF707-202ENST00000418203 2661 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 UAP1-204ENST00000367926 2294 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 OGG1-203ENST00000302036 2220 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 BAIAP2-204ENST00000428708 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 AGAP2-201ENST00000257897 5388 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 ADAMTS19-AS1-201ENST00000502827 786 ntTSL 4 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 F2R-202ENST00000505600 442 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 FAM98C-205ENST00000588262 826 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 CCDC27-201ENST00000294600 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 ADAP1-205ENST00000449296 2093 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 CAPS-201ENST00000452990 1789 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 ZNF211-204ENST00000347302 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 LETM2-208ENST00000524874 1459 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 LYSMD4-210ENST00000545021 2431 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 KRT15-203ENST00000393976 2394 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 SMARCD1-201ENST00000381513 3237 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 ATP2A3-201ENST00000309890 4826 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 IAH1-215ENST00000497473 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 WWP1-202ENST00000517970 4686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 AC018445.1-201ENST00000621571 568 ntTSL 4 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 NEFHP1-201ENST00000412845 2629 ntBASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC18.6■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 ENOPH1-201ENST00000273920 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 AC004706.3-201ENST00000634558 1009 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 SEMA3C-201ENST00000265361 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 GRB10-205ENST00000401949 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 RNF114-201ENST00000244061 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
RBBP7Q16576 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.5 ms