Protein–RNA interactions for Protein: Q16478

GRIK5, Glutamate receptor ionotropic, kainate 5, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIK5Q16478 BOLA2B-201ENST00000305321 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 BOLA2-201ENST00000330978 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 PIGQ-209ENST00000470411 2112 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AC007952.6-201ENST00000573168 2673 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AC003957.1-201ENST00000625108 2673 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 HAAO-201ENST00000294973 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 LINC02106-201ENST00000506534 606 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AC010463.1-201ENST00000596542 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AC011247.3-202ENST00000605062 570 ntTSL 4 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 IRF5-214ENST00000613821 595 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 STARD3-202ENST00000394250 1949 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 SHCBP1L-201ENST00000367547 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AGPAT2-205ENST00000538402 1357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 PRRT1-201ENST00000211413 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 CTBP2-205ENST00000411419 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 PPP1R12C-202ENST00000435544 2363 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 UBE2Q2-204ENST00000561851 1582 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
GRIK5Q16478 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
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