Protein–RNA interactions for Protein: Q16401

PSMD5, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 5, humanhuman

Predictions only

Length 504 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMD5Q16401 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 L3HYPDH-201ENST00000247194 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 LEFTY2-202ENST00000420304 2085 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 CYP21A2-222ENST00000435122 1914 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 MIR1302-2HG-202ENST00000473358 712 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 AC106771.1-201ENST00000502209 372 ntTSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 AC140725.1-202ENST00000561145 712 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 MAFG-AS1-201ENST00000582106 1895 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 SLC16A5-202ENST00000450736 2051 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 TMEM189-201ENST00000371650 2222 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 RBM26-207ENST00000622611 5230 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 HOXB-AS3-203ENST00000465846 434 ntTSL 3 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 NDUFAB1-201ENST00000007516 717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 CLIP3-206ENST00000593074 2080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 NRP2-206ENST00000417189 2386 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 YTHDF3-213ENST00000621820 2363 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 HNRNPA3-204ENST00000435711 1731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 AL645929.1-201ENST00000420084 975 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 NDUFV2-AS1-203ENST00000608008 779 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 TNKS2-201ENST00000371627 6157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 RUVBL2-206ENST00000595090 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 AL603832.1-201ENST00000421943 449 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 LRFN4-201ENST00000309602 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 DNASE1L2-201ENST00000320700 1326 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 FGFR3-210ENST00000613647 4438 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
PSMD5Q16401 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.6 ms