Protein–RNA interactions for Protein: Q16143

SNCB, Beta-synuclein, humanhuman

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Length 134 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNCBQ16143 ANKRD65-204ENST00000520296 1632 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 AC012414.5-201ENST00000564214 1602 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 FGF16-201ENST00000439435 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 AMZ1-202ENST00000407112 1862 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 PIGP-207ENST00000464265 3437 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 NLRP6-203ENST00000534750 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 PCGF3-201ENST00000362003 5685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 UXS1-203ENST00000409501 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ADAMTS13-206ENST00000371929 4934 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SHANK1-201ENST00000293441 6643 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CDCP1-201ENST00000296129 6006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ZNF771-202ENST00000434417 1454 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 PCSK1N-201ENST00000218230 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 STX10-202ENST00000343587 1128 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 YTHDF1-201ENST00000370334 747 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 PTPA-214ENST00000423100 988 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 GRAMD4P2-201ENST00000423297 1097 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 NALT1-201ENST00000429224 738 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 EEF1DP3-203ENST00000566025 782 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ZNF846-212ENST00000592859 1206 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 AC008764.7-201ENST00000593779 1081 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 AC008750.8-201ENST00000600067 551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 FP565260.3-201ENST00000612610 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ZNF385C-205ENST00000618554 2596 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ZNF511-202ENST00000361518 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 TMPRSS5-208ENST00000544476 1320 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 TXNRD2-202ENST00000400518 2025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 AC112229.1-202ENST00000490013 2918 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 RASA4CP-201ENST00000424092 1398 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 NF2-202ENST00000338641 6025 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ZADH2-201ENST00000322342 7732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ZNF619-205ENST00000456778 2192 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 AC099791.1-201ENST00000416440 715 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SERTAD4-AS1-202ENST00000475406 591 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
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SNCBQ16143 AC084032.1-201ENST00000552324 578 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 AL359317.1-201ENST00000556316 578 ntTSL 4 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 UBE2L6-202ENST00000340573 1573 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 RPUSD2-202ENST00000559271 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 BCAM-206ENST00000589651 2686 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 DACT2-203ENST00000607983 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 FICD-204ENST00000552695 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 COL9A1-201ENST00000320755 3059 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 BCL2-202ENST00000398117 7461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 LINC00200-201ENST00000425630 2434 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 TREX2-206ENST00000370232 1864 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SNCBQ16143 FOXD4L4-201ENST00000377413 2230 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
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