Protein–RNA interactions for Protein: Q15768

EFNB3, Ephrin-B3, humanhuman

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Length 340 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB3Q15768 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 RAI14-201ENST00000265109 5092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 TCP11-209ENST00000444780 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 ANGPTL4-201ENST00000301455 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 DPF1-203ENST00000414789 1960 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 AC008073.3-201ENST00000610442 2281 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 PI4KB-213ENST00000529142 2603 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 ZNF337-AS1-204ENST00000428254 817 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 LINC01063-201ENST00000441644 348 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 AC243829.1-201ENST00000615128 1059 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 COL13A1-201ENST00000354547 3027 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 CASTOR1-202ENST00000407689 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 NOL3-211ENST00000568146 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 RETREG2-203ENST00000430297 4618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 NRL-206ENST00000561028 2103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 SLC16A5-206ENST00000580123 2019 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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EFNB3Q15768 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 AL031133.1-201ENST00000406807 723 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 ISOC2-202ENST00000425675 998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 AL136307.1-201ENST00000454882 411 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
EFNB3Q15768 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
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