Protein–RNA interactions for Protein: Q15699

ALX1, ALX homeobox protein 1, humanhuman

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Length 326 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALX1Q15699 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
ALX1Q15699 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CROCCP3-202ENST00000420820 1947 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 DIO3OS-212ENST00000557661 1937 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 EOMES-202ENST00000449599 2829 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 LRRC1-202ENST00000370888 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 PCCA-201ENST00000376279 2418 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 TCTN1-223ENST00000550703 2149 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CBSL-210ENST00000624934 1992 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 SP9-201ENST00000394967 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 BUD23-201ENST00000265758 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 BRSK2-201ENST00000308219 4089 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CLN3-204ENST00000357857 1720 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 PLEKHA2-206ENST00000521746 2127 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 DGCR6-201ENST00000331444 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AL031598.1-201ENST00000561511 1773 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 PDP1-208ENST00000520728 2554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CMTM7-201ENST00000334983 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 SLC52A2-205ENST00000526752 710 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 AC034236.2-201ENST00000606662 1610 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
ALX1Q15699 PGAM1-201ENST00000334828 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
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