Protein–RNA interactions for Protein: Q15645

TRIP13, Pachytene checkpoint protein 2 homolog, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 432 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIP13Q15645 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 AL354751.1-201ENST00000412768 1863 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 AC107464.1-203ENST00000468356 2120 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 NBPF21P-201ENST00000425093 1451 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 TWF2-203ENST00000499914 1440 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 MAEA-208ENST00000505839 1444 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 RNF135-204ENST00000443677 1261 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 AC068831.2-201ENST00000448987 367 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 EXOSC4-202ENST00000525936 606 ntTSL 3 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 GTF2IRD2B-206ENST00000614064 573 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 LYSMD4-201ENST00000332728 2847 ntTSL 4 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 CD276-201ENST00000318424 2738 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 POMC-201ENST00000264708 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 SYNE2-201ENST00000341472 1132 ntTSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 MMP25-204ENST00000612971 1017 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 AC005225.2-202ENST00000617980 408 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 FP475955.1-201ENST00000624937 553 ntTSL 4 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
TRIP13Q15645 NR4A2-204ENST00000409572 2878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 SH3BP2-202ENST00000435136 2318 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 ARID1A-201ENST00000324856 8577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC19.52■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 ZNF74-202ENST00000400451 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 IL17RC-215ENST00000455057 2244 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 LINC00708-201ENST00000428165 916 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 LINC00894-209ENST00000458274 547 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 CAPN5-206ENST00000531028 534 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 C1QL1P1-201ENST00000568105 661 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 AC127496.6-201ENST00000576215 338 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 AC008403.3-201ENST00000598924 454 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 P2RX2-206ENST00000389110 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 THAP7-201ENST00000215742 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
TRIP13Q15645 AC035140.1-201ENST00000507957 493 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.2 ms