Protein–RNA interactions for Protein: Q15475

SIX1, Homeobox protein SIX1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 284 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIX1Q15475 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 MRPL4-202ENST00000307422 1320 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.47■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 COL15A1-205ENST00000610452 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 ZNF487-202ENST00000437590 2111 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 SLC25A51-202ENST00000377716 1691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 C19orf54-203ENST00000470681 2521 ntTSL 2 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 PDZRN3-202ENST00000308537 1136 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 PRSS57-201ENST00000329267 1025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 BAALC-AS1-207ENST00000522856 594 ntTSL 3 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 AC124016.1-201ENST00000609552 612 ntBASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 PRSS57-202ENST00000613411 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 TRPV4-208ENST00000544971 2295 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 GPC2-201ENST00000292377 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
SIX1Q15475 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 SOX4-201ENST00000244745 5852 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 C19orf25-201ENST00000427685 1410 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 MRGPRG-201ENST00000332314 870 ntAPPRIS P1 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 AC133681.1-201ENST00000465482 601 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 FN3KRP-201ENST00000269373 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 SLC12A4-202ENST00000422611 4670 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 PTP4A3-202ENST00000349124 2710 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 AC142086.1-202ENST00000398669 1839 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 HCG18-235ENST00000426882 4862 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 IL17C-201ENST00000244241 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 IPO13-201ENST00000372339 1201 ntTSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 UCHL5-202ENST00000367449 1507 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 ADAMTS16-203ENST00000511368 2682 ntTSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 MAFF-201ENST00000338483 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 FAM69B-201ENST00000371691 2410 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 LINC00466-207ENST00000634725 1736 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 NIFKP9-201ENST00000419265 221 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 ABBA01031674.1-201ENST00000635145 728 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 C2CD2L-205ENST00000528586 2320 ntTSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 LRRC32-202ENST00000404995 2656 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
SIX1Q15475 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC19.42■□□□□ 0.7
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