Protein–RNA interactions for Protein: Q15154

PCM1, Pericentriolar material 1 protein, humanhuman

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Length 2,024 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCM1Q15154 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PCM1Q15154 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 CHCHD6-201ENST00000290913 1006 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PCM1Q15154 SMN2-215ENST00000628696 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AP2M1-201ENST00000292807 1931 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ASGR1-208ENST00000574388 1552 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 RNF170-205ENST00000526349 1338 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 CCNC-207ENST00000518714 1426 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 IDUA-201ENST00000247933 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
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PCM1Q15154 LGR4-202ENST00000389858 5163 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
PCM1Q15154 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PCM1Q15154 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
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PCM1Q15154 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PCM1Q15154 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
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PCM1Q15154 ANKRD54-211ENST00000609454 825 ntTSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
PCM1Q15154 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29 ms