Protein–RNA interactions for Protein: Q15139

PRKD1, Serine/threonine-protein kinase D1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD1Q15139 HEIH-201ENST00000623091 1652 ntBASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 ANO7L1-203ENST00000602586 1720 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 LIME1-201ENST00000309546 1178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CBLN3-202ENST00000555436 718 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 PNMA8A-203ENST00000602246 572 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AC068587.9-201ENST00000641814 219 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 IMMP2L-202ENST00000405709 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 AGAP1-205ENST00000409538 6138 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 RAPH1-201ENST00000308091 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 PACSIN2-203ENST00000402229 1883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 HAPLN4-201ENST00000291481 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.69
PRKD1Q15139 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 PIN1-201ENST00000247970 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 AC092718.1-201ENST00000501068 1088 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 Z99916.2-201ENST00000604037 246 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 AL445433.2-201ENST00000425113 2544 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 LMO4-202ENST00000370544 5405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 RTN4-207ENST00000402434 1456 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 CNNM3-202ENST00000377060 3308 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC19.33■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 TRIM74-201ENST00000285805 1350 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 TRIM73-201ENST00000323819 1358 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 ITPKB-203ENST00000429204 6162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 SLCO4A1-201ENST00000217159 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 WDR74-201ENST00000278856 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 AK2-201ENST00000354858 1021 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 VSIG2-202ENST00000403470 1191 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 PENK-204ENST00000518770 863 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 DGCR10-201ENST00000609839 495 ntBASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 STMN3-202ENST00000540534 2351 ntTSL 2 BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 TFEB-203ENST00000358871 2188 ntTSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 TSGA10IP-203ENST00000532620 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 PLEKHB2-204ENST00000409158 2277 ntTSL 2 BASIC19.31■□□□□ 0.68
PRKD1Q15139 WIZP1-201ENST00000531444 2299 ntBASIC19.31■□□□□ 0.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms