Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 288 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RPP25L-201ENST00000297613 1092 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 NKAIN4-201ENST00000370307 793 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 TK2-204ENST00000525974 1178 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 MIR4497-201ENST00000583208 89 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AC122129.2-201ENST00000583598 466 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 TTLL3-209ENST00000426895 2767 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 CARD9-202ENST00000371734 1814 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AATK-AS1-203ENST00000637878 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 MPP5-201ENST00000261681 5552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 STX6-201ENST00000258301 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ODF3L2-202ENST00000382696 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 FBXL18-203ENST00000453700 1932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 NELFE-206ENST00000444811 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 SUMO2-203ENST00000578238 490 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 FLT3LG-211ENST00000600429 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 URI1-202ENST00000392271 3444 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 HMBS-214ENST00000542729 1469 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 HAUS1-201ENST00000282058 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 NPIPA8-201ENST00000525596 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ATPAF1-214ENST00000576409 4158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 NAPA-210ENST00000595227 1460 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 EPB41L2-211ENST00000525271 2568 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.18
PDCD1Q15116 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
PDCD1Q15116 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43 ms