Protein–RNA interactions for Protein: Q15050

RRS1, Ribosome biogenesis regulatory protein homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRS1Q15050 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 NDUFA10-202ENST00000307300 1313 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 SWI5-201ENST00000320188 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 AC011498.5-201ENST00000592027 486 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 AC005906.2-203ENST00000640962 2091 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 SLC23A3-201ENST00000295738 2037 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 LONP1-203ENST00000585374 2882 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 MGAT3-201ENST00000341184 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 ST3GAL3-204ENST00000335430 1805 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 MIR4300HG-201ENST00000500502 1397 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 AC016734.2-201ENST00000624325 1377 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 RCN1-201ENST00000054950 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 PUF60-202ENST00000349157 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 AC141586.3-201ENST00000562166 1838 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 ARHGAP22-210ENST00000477708 1951 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 PAQR4-203ENST00000572687 2251 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
RRS1Q15050 TRIM46-204ENST00000368385 1864 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 ENSA-205ENST00000361532 792 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 EMX1-202ENST00000394111 1528 ntTSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 NAB2-202ENST00000342556 2318 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 ILDR2-203ENST00000469934 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 ERVK13-1-203ENST00000564340 1449 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 AP002383.4-201ENST00000442518 975 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 AGBL5-AS1-201ENST00000444217 407 ntTSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 AL136038.4-201ENST00000603606 1261 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC25.19■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 RPLP0-219ENST00000551150 1344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 CTBP2-202ENST00000334808 2130 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 MED25-201ENST00000312865 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 CYB561-213ENST00000581573 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 AC009133.6-201ENST00000609618 2252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 FAM76B-204ENST00000536839 2546 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 RAC1-201ENST00000348035 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 ALDOA-221ENST00000566897 2448 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
RRS1Q15050 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.8 ms