Protein–RNA interactions for Protein: Q15034

HERC3, Probable E3 ubiquitin-protein ligase HERC3, humanhuman

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Length 1,050 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERC3Q15034 CFAP100-203ENST00000505024 1994 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PYCR1-204ENST00000403172 1811 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 MADD-208ENST00000405573 1823 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC018470.1-201ENST00000624790 3129 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC104417.2-201ENST00000562989 1793 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ZNF668-208ENST00000538906 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC012618.2-201ENST00000428058 849 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 GLYCTK-205ENST00000473032 935 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC019257.1-201ENST00000517676 557 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 CNOT8-224ENST00000523698 862 ntTSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC089999.2-201ENST00000552525 248 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC015712.2-203ENST00000560461 688 ntTSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC091551.1-201ENST00000590722 1228 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC010336.4-201ENST00000595655 438 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 WBP2-213ENST00000590221 1745 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 VIPR1-201ENST00000325123 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 KLHDC4-203ENST00000347925 1821 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 NFATC4-228ENST00000556759 2025 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AC126773.2-201ENST00000562172 1682 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 MATN4-203ENST00000372754 2200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 KIF16B-206ENST00000636835 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ARNT-202ENST00000358595 4887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PTPRCAP-201ENST00000326294 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 C6orf132-202ENST00000356542 894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 HES2-203ENST00000377837 1222 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PLK3-201ENST00000372201 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SDHAP1-207ENST00000440850 2000 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 NADK-201ENST00000341426 3235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ILKAP-201ENST00000254654 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 DUSP15-209ENST00000486996 1651 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PTK6-201ENST00000217185 2401 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 THOC3-208ENST00000513482 1796 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 GDF5OS-201ENST00000374375 1734 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 CXorf49-202ENST00000535490 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 CXorf49B-202ENST00000542739 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 IZUMO2-201ENST00000293405 728 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 BSX-201ENST00000343035 830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 AP000697.1-201ENST00000430607 339 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 HGNC:18790-208ENST00000506380 798 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 ATP6V0E1-204ENST00000519911 718 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
HERC3Q15034 MOK-228ENST00000523231 1114 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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