Protein–RNA interactions for Protein: Q147U7

SMCO1, Single-pass membrane and coiled-coil domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 214 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMCO1Q147U7 CEACAM4-203ENST00000600925 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 SP2-202ENST00000613139 908 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 AC093762.2-201ENST00000641700 291 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 MARC2-201ENST00000359316 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 TRAF4-201ENST00000262395 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.83■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 RAB4B-EGLN2-201ENST00000594136 2554 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CHRNA10-201ENST00000250699 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CAMTA1-201ENST00000303635 8444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CROT-202ENST00000412227 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 AC005837.3-201ENST00000612163 286 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FBXO6-201ENST00000376753 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PPM1D-204ENST00000629650 1525 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CLN3-240ENST00000631023 1586 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 MRPL23-AS1-201ENST00000419080 1876 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PGAP1-204ENST00000409475 2443 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 TNFRSF18-201ENST00000328596 851 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FOXB2-201ENST00000376708 1299 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 KRT18P68-201ENST00000392293 1000 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 MOSPD3-203ENST00000393950 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 INPP5J-205ENST00000404390 2215 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FRMD5-202ENST00000417257 5011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 UQCRFS1P1-201ENST00000435169 820 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 GCK-205ENST00000437084 1385 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 AC023632.3-201ENST00000521633 145 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 C19orf25-203ENST00000585675 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 RPS15-206ENST00000589656 473 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 GNE-201ENST00000377902 2565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PODXL2-201ENST00000342480 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 ABALON-201ENST00000629058 1903 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 NF2-203ENST00000353887 1845 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 HNRNPLL-206ENST00000410076 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 SF1-203ENST00000377387 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 ITPR3-201ENST00000374316 9870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 IGSF9-206ENST00000611023 2663 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 RPUSD3-206ENST00000433535 1178 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 ATP6V0B-205ENST00000472174 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 AC037459.4-201ENST00000517384 585 ntTSL 4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 FOXE1-201ENST00000375123 3462 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
SMCO1Q147U7 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms