Protein–RNA interactions for Protein: Q14684

RRP1B, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 758 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRP1BQ14684 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 KLC1-208ENST00000452929 2453 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 PRMT8-202ENST00000382622 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 FAM41C-202ENST00000432963 504 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 ADAP1-217ENST00000611167 2118 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
RRP1BQ14684 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 UBQLN4P1-201ENST00000461599 1801 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 CADM1-222ENST00000616271 1246 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 VWA8-AS1-201ENST00000611103 2079 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 KATNBL1P6-202ENST00000562413 1466 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 SKI-201ENST00000378536 5613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PRKRA-203ENST00000432031 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 RELB-202ENST00000505236 2219 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 UTP4-201ENST00000314423 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 SCO1-203ENST00000577427 1601 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 KRT18P23-201ENST00000435622 1283 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AC004771.4-201ENST00000576752 474 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AFG3L1P-217ENST00000557444 2447 ntBASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 THOP1-202ENST00000395212 1877 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 SRSF1-208ENST00000584773 1317 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 BX276092.5-203ENST00000456199 560 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AP002414.4-201ENST00000589764 1148 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AL121672.3-201ENST00000608644 468 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 MARK4-211ENST00000622871 1147 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 UPP1-201ENST00000331803 1932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 EML2-220ENST00000589876 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 SMIM4-203ENST00000477703 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 PRMT5-201ENST00000216350 2271 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 CEP85L-205ENST00000419517 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 FMNL2-201ENST00000288670 5575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 MSLN-205ENST00000563941 2109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
RRP1BQ14684 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
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