Protein–RNA interactions for Protein: Q14683

SMC1A, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC1AQ14683 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 MYEOV-202ENST00000441339 1996 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 SYNE4-202ENST00000340477 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 UBE2C-204ENST00000356455 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 GDAP1L1-202ENST00000372952 722 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 AL050404.1-201ENST00000424566 802 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 EGLN1P1-201ENST00000531623 762 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 FICD-201ENST00000361549 1816 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC20.98■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ETV7-206ENST00000615781 1776 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 RHOA-202ENST00000418115 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 EDARADD-201ENST00000334232 858 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 TSPY1-201ENST00000423647 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 TREX1-205ENST00000625293 1783 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 DOLPP1-203ENST00000406974 2037 ntTSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 BX119927.1-201ENST00000636596 1552 ntBASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ZSCAN1-201ENST00000282326 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 DGKI-202ENST00000424189 4163 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 STK25-204ENST00000405585 1643 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ECE1-205ENST00000436918 2328 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 MSLN-201ENST00000382862 2116 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 KRT16P6-202ENST00000425692 1426 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ACSF2-201ENST00000300441 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 C1orf50-201ENST00000372525 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 C9orf129-201ENST00000375419 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 AL133410.2-201ENST00000425499 696 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 NCF1B-202ENST00000432102 930 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 TUBB8P6-201ENST00000436895 1288 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ISOC2-201ENST00000085068 1122 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 TMC6-203ENST00000392467 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ZNF623-203ENST00000526926 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 TMEM179-206ENST00000616017 1645 ntBASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 MEF2B-201ENST00000409224 1683 ntTSL 2 BASIC20.96■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 ANKRD2-202ENST00000307518 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC20.95■□□□□ 0.95
SMC1AQ14683 BEST4-201ENST00000372207 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 MTFR1L-203ENST00000374303 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 BTBD9-205ENST00000419706 2034 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AL691432.2-201ENST00000607222 2038 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 RAB34-204ENST00000395245 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 SLC25A15-201ENST00000338625 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 TMEM131-201ENST00000186436 6640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AC128688.1-201ENST00000487626 519 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 KRT18P16-201ENST00000510337 1294 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
SMC1AQ14683 AC087388.1-201ENST00000571370 1112 ntBASIC20.95■□□□□ 0.94
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