Protein–RNA interactions for Protein: Q14549

GBX1, Homeobox protein GBX-1, humanhuman

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Length 363 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GBX1Q14549 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 MIB2-203ENST00000378712 2890 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 KIF22-201ENST00000160827 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 AC008763.3-201ENST00000597959 777 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 AL138781.2-201ENST00000617896 1843 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 CDC14B-208ENST00000463569 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 HDAC4-201ENST00000345617 8976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 HDAC4-215ENST00000543185 8990 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 TGFBR1-201ENST00000374990 5720 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 SNAP47-202ENST00000366759 2362 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 UPF1-201ENST00000262803 5348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 RHOBTB2-201ENST00000251822 5451 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 UVSSA-207ENST00000511216 2927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 SPIRE2-201ENST00000378247 3235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 KLHDC2-201ENST00000298307 5514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 INAVA-202ENST00000413687 2197 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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GBX1Q14549 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 C7orf50-203ENST00000397100 1264 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
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GBX1Q14549 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
GBX1Q14549 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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GBX1Q14549 TNFRSF8-202ENST00000413146 2363 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
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GBX1Q14549 GALE-201ENST00000374497 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 TRIP4-201ENST00000261884 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
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GBX1Q14549 SEPT9-246ENST00000592951 1793 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 RENBP-202ENST00000393700 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 HEXDC-203ENST00000577944 1820 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 VCY1B-201ENST00000250823 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 VCY-201ENST00000250825 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 C12orf76-208ENST00000551185 496 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 ASB6-202ENST00000277459 2180 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CASC2-205ENST00000454781 2216 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 AGTR1-201ENST00000349243 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
GBX1Q14549 PRMT5-204ENST00000397441 2418 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
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