Protein–RNA interactions for Protein: Q13492

PICALM, Phosphatidylinositol-binding clathrin assembly protein, humanhuman

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Length 652 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PICALMQ13492 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 KCTD10-211ENST00000540411 866 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 STXBP6-203ENST00000419632 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AKAP8L-201ENST00000397410 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 DMRTA2-202ENST00000418121 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 SPTBN4-207ENST00000595535 6105 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 C2orf54-201ENST00000307486 2017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 NEK3-208ENST00000618534 2414 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 TMEM190-201ENST00000291934 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 TMEM88-201ENST00000301599 875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 TMPRSS6-207ENST00000442782 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 JDP2-201ENST00000267569 1700 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 SEPT9-236ENST00000591088 1691 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 SLC39A1-209ENST00000537590 2022 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 UBE2E1-AS1-201ENST00000426702 778 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 CNP-204ENST00000472031 1019 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 NARS2-201ENST00000281038 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 ADGRA2-201ENST00000315215 6270 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 TMEM104-202ENST00000417024 1781 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 SNX8-201ENST00000222990 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 HEXDC-201ENST00000327949 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 NRXN1-226ENST00000626899 2543 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 SLC35A3-205ENST00000465289 5696 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 FOXD4-201ENST00000382500 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 NBL1-209ENST00000548815 1953 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 TM9SF1-203ENST00000524835 1938 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AL596442.1-201ENST00000429305 429 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AP000347.1-209ENST00000437294 557 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 KRT126P-201ENST00000549467 1181 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AC079602.3-201ENST00000623931 403 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 SPACA6-213ENST00000637797 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 SPNS2-201ENST00000329078 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AC233280.1-201ENST00000423600 1684 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 PLEKHM2-202ENST00000375799 4122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 C3orf18-203ENST00000426034 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 POLI-202ENST00000406285 2030 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 KCNMB3-202ENST00000349697 1228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 KCNMA1-293ENST00000640969 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 HSPD1-202ENST00000388968 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 FLT1-204ENST00000541932 2969 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
PICALMQ13492 GJA8-201ENST00000369235 1302 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
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