Protein–RNA interactions for Protein: Q13426

XRCC4, DNA repair protein XRCC4, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC4Q13426 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 PTMS-201ENST00000309083 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 NDUFA13-203ENST00000503283 825 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AC006504.5-207ENST00000586220 487 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AC020922.2-201ENST00000596786 359 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 KRTAP5-11-203ENST00000617152 558 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 KCNQ5-202ENST00000355194 6566 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 KCNQ5-206ENST00000402622 6596 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 TCP11-204ENST00000373979 1882 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 CSF1-203ENST00000369801 1364 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 TH-202ENST00000333684 1535 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AC120498.9-201ENST00000339021 3867 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 FBXO28-202ENST00000424254 1334 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 GRM2-204ENST00000442933 2064 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 TMEM240-202ENST00000425828 717 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 KSR1P1-201ENST00000446298 240 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 C1QBPP2-201ENST00000528754 825 ntBASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 HLX-AS1-201ENST00000552026 563 ntTSL 4 BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 EGFR-202ENST00000342916 2239 ntTSL 1 (best) BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 C6orf223-202ENST00000439969 2757 ntTSL 2 BASIC19.55■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 SLC43A1-201ENST00000278426 2598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 SERGEF-201ENST00000265965 1566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 B4GALT2-202ENST00000356836 2629 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 NDUFB10-201ENST00000268668 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 RAC3-201ENST00000306897 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 PPP1R14BP5-201ENST00000440334 435 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AC073111.3-201ENST00000478789 635 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AMN1-211ENST00000541931 880 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 C14orf144-202ENST00000555282 854 ntTSL 3 BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 MRPL4-204ENST00000588502 827 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 C19orf25-213ENST00000592872 1287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AC004816.2-201ENST00000622856 284 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 NPLOC4-201ENST00000331134 4415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 PFN2-203ENST00000452853 1780 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 CCNJ-202ENST00000403870 2830 ntTSL 5 BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 AP001351.1-201ENST00000501397 1865 ntTSL 2 BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ZNF446-207ENST00000610298 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ZFP92-201ENST00000338647 6105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 CAPN10-202ENST00000270364 1267 ntTSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
XRCC4Q13426 HOTAIRM1-203ENST00000429611 722 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
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