Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 PRKCSH-209ENST00000589838 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 DBNL-210ENST00000448521 1808 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 SPEG-204ENST00000396689 1274 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 RNF187-203ENST00000639044 708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 NR2F2-201ENST00000394166 5275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 PRSS36-202ENST00000418068 2446 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 TMEM132A-202ENST00000453848 3346 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 REPS1-203ENST00000409812 2511 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 SLC50A1-201ENST00000303343 1137 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 DSCC1-201ENST00000313655 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 PTOV1-AS1-201ENST00000596521 2155 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 BRSK1-201ENST00000309383 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 PIGQ-204ENST00000409527 1915 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AC148477.3-202ENST00000376617 1766 ntTSL 2 BASIC25.67■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 BAZ1B-202ENST00000404251 5428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 SPHK1-207ENST00000590959 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 LINC01311-201ENST00000565162 1445 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AC009041.2-204ENST00000568394 3343 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 MRPS15-201ENST00000373116 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 HYMAI.1-201ENST00000620949 238 ntBASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 KMT5C-201ENST00000255613 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 ZNF394-203ENST00000426306 2017 ntTSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 MPZL1-201ENST00000359523 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 BTD-202ENST00000383778 2261 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 SYTL1-210ENST00000616558 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 ALDOA-212ENST00000564546 2104 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 ISOC2-203ENST00000438389 1566 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 PSMD6-201ENST00000295901 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 KRT8P45-201ENST00000414328 1447 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 TRPV3-209ENST00000576742 2766 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 NAGPA-AS1-202ENST00000632058 2265 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 CASP9-210ENST00000546424 4463 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 ACOT4-201ENST00000326303 2362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AC004870.1-201ENST00000315132 882 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 MRPL53-202ENST00000409710 386 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 SLC5A10-205ENST00000417251 1984 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 FAM217A-208ENST00000639338 1929 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 CSPG5-201ENST00000264723 4080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 CNOT9-209ENST00000627282 1621 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 TLCD1-202ENST00000394933 784 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 BECN2-201ENST00000419583 1296 ntAPPRIS P1 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 SMIM22-203ENST00000588500 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC25.64■■□□□ 1.7
PDE3BQ13370 LINC01465-201ENST00000408887 1940 ntBASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 NDUFA10-203ENST00000404554 1557 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.69
PDE3BQ13370 KRT9-201ENST00000246662 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
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