Protein–RNA interactions for Protein: Q13352

ITGB3BP, Centromere protein R, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 177 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGB3BPQ13352 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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ITGB3BPQ13352 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 LARGE2-202ENST00000401752 2516 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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ITGB3BPQ13352 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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ITGB3BPQ13352 ZBTB33-202ENST00000557385 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 NR1H2-202ENST00000411902 1466 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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ITGB3BPQ13352 AC140125.2-201ENST00000502515 1517 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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ITGB3BPQ13352 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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ITGB3BPQ13352 GPR146-201ENST00000397095 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ITGB3BPQ13352 ZNF554-201ENST00000317243 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ITGB3BPQ13352 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ITGB3BPQ13352 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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ITGB3BPQ13352 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
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ITGB3BPQ13352 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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ITGB3BPQ13352 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 PMEPA1-204ENST00000395814 800 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 LY6E-210ENST00000521182 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 RMI2-205ENST00000576027 818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 MMP28-204ENST00000615136 2033 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 GUCA1A-205ENST00000541991 1921 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
ITGB3BPQ13352 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
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