Protein–RNA interactions for Protein: Q13332

PTPRS, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase S, humanhuman

Predictions only

Length 1,948 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRSQ13332 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 SLC11A2-208ENST00000546743 1740 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 MTMR14-201ENST00000296003 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
PTPRSQ13332 SNUPN-205ENST00000564644 1931 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 IKBKG-207ENST00000611071 2103 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 IGHV3-15-201ENST00000390603 437 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 SCRN1-203ENST00000409570 535 ntTSL 4 BASIC20.08■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 TRMU-201ENST00000290846 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 VGF-201ENST00000249330 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 AL390879.2-201ENST00000424306 2222 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 TH-206ENST00000381178 1910 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 SUMO3-204ENST00000411651 1921 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 VSX1-202ENST00000376709 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 TTC3-203ENST00000399010 2115 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 ODF3B-205ENST00000428989 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 DRAM2-201ENST00000286692 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 BACE1-204ENST00000445823 1408 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 MRPS5-201ENST00000272418 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 LRPPRC-202ENST00000409659 1610 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 ZNF497-202ENST00000425453 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 PDCD2-204ENST00000453163 2657 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 NDUFB9-201ENST00000276689 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 SLC35D3-201ENST00000331858 2359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 FAM83D-201ENST00000619304 2475 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 SUMF2-201ENST00000275607 1894 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 LINC01714-202ENST00000635451 896 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 AL512353.2-201ENST00000448759 1962 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 HDHD5-201ENST00000155674 1735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 KLF2-201ENST00000248071 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 HMOX2-218ENST00000619913 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 AP000679.1-202ENST00000319763 2081 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 EARS2-210ENST00000564501 2027 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 MIEN1-205ENST00000577810 806 ntTSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 HAND2-AS1-237ENST00000616485 2420 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 KIRREL2-201ENST00000262625 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 KIF22-203ENST00000561482 2505 ntTSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 WNT6-201ENST00000233948 1703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
PTPRSQ13332 C19orf66-201ENST00000253110 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.04■□□□□ 0.8
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