Protein–RNA interactions for Protein: Q13219

PAPPA, Pappalysin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,627 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PAPPAQ13219 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 SMIM3-201ENST00000526627 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 TMC6-201ENST00000306591 1681 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 SCT-201ENST00000176195 366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 KRT18P58-201ENST00000527480 1120 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 ZNF276-208ENST00000568064 2203 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 NGEF-202ENST00000373552 2286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 CXCR3-201ENST00000373691 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 GABRA2-214ENST00000515082 2366 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 AC112907.3-201ENST00000577781 2400 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 ANKLE1-204ENST00000594072 2294 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 GOLGA7-203ENST00000518270 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 EFCAB11-211ENST00000556609 568 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 TCP11-202ENST00000311875 2166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 GPT-205ENST00000528431 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 AL035252.2-201ENST00000454676 3168 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 SRP9-203ENST00000366839 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 AC068594.1-202ENST00000581657 749 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 AC010240.3-201ENST00000607688 395 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
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PAPPAQ13219 ELMOD1-206ENST00000531234 1832 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 LIMS2-207ENST00000409808 2315 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 NKD2-201ENST00000274150 1940 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 BYSL-201ENST00000230340 2029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 AL109659.2-201ENST00000606809 1674 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 TOM1L1-202ENST00000445275 2228 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 AC092865.5-201ENST00000545435 363 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 NECAB3-202ENST00000375238 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 SPATS2L-204ENST00000409140 2463 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 SPATA5L1-201ENST00000305560 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 ISYNA1-206ENST00000578963 1691 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 GSTZ1-218ENST00000557053 580 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 CFP-203ENST00000396992 1592 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 NPNT-214ENST00000514622 2362 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PAPPAQ13219 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
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