Protein–RNA interactions for Protein: Q13137

CALCOCO2, Calcium-binding and coiled-coil domain-containing protein 2, humanhuman

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Length 446 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CALCOCO2Q13137 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 LMF1-212ENST00000568897 1603 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 TMEM74-201ENST00000297459 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 DCXR-201ENST00000306869 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 NDUFB1-201ENST00000329559 528 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AC093620.1-201ENST00000342963 583 ntTSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 TREX2-204ENST00000370212 861 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 TREX2-205ENST00000370231 1255 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 TREX2-207ENST00000393862 907 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 HAGLR-207ENST00000452365 661 ntTSL 4 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 CIRBP-213ENST00000587323 1092 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AL121829.2-201ENST00000620908 328 ntBASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 F11R-202ENST00000368026 4835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 ETFA-202ENST00000433983 1346 ntTSL 2 BASIC19.51■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 FAM228A-201ENST00000295150 1774 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 MFSD1-201ENST00000264266 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 CAVIN3-201ENST00000303927 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 NENF-201ENST00000366988 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 NOXO1-203ENST00000397280 1147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 NOXO1-205ENST00000566005 1144 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 HLA-B-256ENST00000639848 1089 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 PDE9A-209ENST00000398227 1606 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 CMIP-209ENST00000566513 2288 ntTSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SLC22A15-201ENST00000369502 1230 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 CDCA4P2-201ENST00000441182 718 ntBASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 MTAP-204ENST00000460874 1434 ntTSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 MPV17L2-204ENST00000599612 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 CACNA1A-201ENST00000360228 8627 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.49■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 NPNT-203ENST00000427316 2481 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 GATS-209ENST00000454084 1030 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 LEF1-AS1-203ENST00000507799 459 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 BET1L-207ENST00000529614 560 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 LINC02091-201ENST00000576171 1185 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 PTMS-207ENST00000619580 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 UBFD1-201ENST00000395878 5110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
CALCOCO2Q13137 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
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