Protein–RNA interactions for Protein: Q12873

CHD3, Chromodomain-helicase-DNA-binding protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,000 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHD3Q12873 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 SAPCD2P2-201ENST00000431719 1174 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 DIP2A-203ENST00000435722 2760 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 STARD10-213ENST00000538536 1678 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 P2RX5-202ENST00000345901 2031 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 SUMF2-202ENST00000342190 1876 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 LRRC23-207ENST00000433346 1387 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 CDH24-205ENST00000554034 2759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 HGFAC-204ENST00000511533 2016 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 AC091153.3-201ENST00000497885 472 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 CXXC5-AS1-201ENST00000514287 577 ntTSL 4 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 AC093458.2-201ENST00000623150 629 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 IQCJ-SCHIP1-207ENST00000638749 2633 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 HSPB6-201ENST00000004982 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 SLC25A48-204ENST00000433282 1111 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 ZNF575-205ENST00000601282 1086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 MB21D2-201ENST00000392452 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 C2orf81-201ENST00000290390 2227 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 KCNH2-201ENST00000262186 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 KRT8P11-201ENST00000409686 1436 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 LYSMD4-202ENST00000344791 2885 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 FAM3A-215ENST00000447601 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 AC064807.1-201ENST00000518942 816 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 EEF1A1-203ENST00000331523 1923 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 AC124066.1-201ENST00000581122 1660 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 ANXA8L1-203ENST00000613703 1874 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 ZFYVE9-201ENST00000287727 5194 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 FUCA1-201ENST00000374479 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 NR1H2-201ENST00000253727 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 HCK-206ENST00000518730 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 AC011944.1-201ENST00000316148 1900 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 PRSS44-201ENST00000515154 1146 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 RNASET2-213ENST00000611959 1124 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 KCNC3-203ENST00000477616 3176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 ANXA8L1-201ENST00000584982 2174 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 TFEB-211ENST00000420312 1996 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 ADORA2A-201ENST00000337539 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 CYB561-205ENST00000542042 1302 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 AP000974.1-201ENST00000623909 2387 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
CHD3Q12873 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
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