Protein–RNA interactions for Protein: Q0VFZ6

CCDC173, Coiled-coil domain-containing protein 173, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC173Q0VFZ6 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 DHPS-223ENST00000614126 1124 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
CCDC173Q0VFZ6 PCGF3-208ENST00000470161 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 CAMKK2-206ENST00000402834 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 AD000671.2-201ENST00000589807 1925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 AC005865.2-201ENST00000505276 2303 ntTSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 ARL5A-201ENST00000295087 5326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SYTL3-201ENST00000297239 2292 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 APCDD1-201ENST00000355285 3809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 KBTBD11-201ENST00000320248 6710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 EWSR1-222ENST00000629659 2446 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 RAP1B-220ENST00000539091 977 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 EXTL3-213ENST00000523149 1779 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 RTCA-203ENST00000370128 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 CLCN2-204ENST00000434054 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 MTSS1-203ENST00000431961 1711 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 AC108860.2-201ENST00000562760 2183 ntBASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 KIAA1586-203ENST00000545356 2883 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 HLA-G-201ENST00000360323 1427 ntAPPRIS P2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 CDK10-202ENST00000353379 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 LEF1-201ENST00000265165 3068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 RALGAPA1-219ENST00000637992 8512 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 LINC02199-202ENST00000510067 1008 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 EXTL3-201ENST00000220562 6483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 MCM7-203ENST00000354230 2975 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 BABAM1-208ENST00000598188 1470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 HNRNPM-217ENST00000620401 2458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 STARD3-209ENST00000544210 1666 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 TMEM235-203ENST00000550981 1786 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 PDZD7-201ENST00000370215 2032 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 E2F2-201ENST00000361729 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 WDR41-208ENST00000507029 1553 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 HDAC11-221ENST00000522202 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SHE-201ENST00000304760 6243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 ALKBH6-213ENST00000486389 1525 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CCDC173Q0VFZ6 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.4 ms