Protein–RNA interactions for Protein: Q0D2K0

NIPAL4, Magnesium transporter NIPA4, humanhuman

Predictions only

Length 466 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NIPAL4Q0D2K0 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 CFAP46-201ENST00000368585 1825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 RASSF1-210ENST00000616212 1842 ntTSL 2 BASIC19.21■□□□□ 0.67
NIPAL4Q0D2K0 FBXO41-204ENST00000520530 3293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC28-204ENST00000617313 2237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 CD70-201ENST00000245903 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AC073343.2-203ENST00000366167 564 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ID1-202ENST00000376112 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 HDAC11-205ENST00000404548 577 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 FAM86C2P-201ENST00000525180 435 ntTSL 4 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 MSLN-207ENST00000566549 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 CPEB2-207ENST00000507071 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ETS1-207ENST00000531611 2134 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AP1AR-202ENST00000309703 2337 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 SIGLEC10-204ENST00000436984 1776 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 MSLN-202ENST00000545450 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TPPP3-201ENST00000290942 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TPPP3-202ENST00000393957 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 MIR1238-201ENST00000408483 83 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 CCDC74B-204ENST00000409234 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 FOXN3-AS1-201ENST00000555562 1077 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ZNRF1-202ENST00000335325 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 DCAF4-201ENST00000353777 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PRMT1-201ENST00000391851 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 MEN1-205ENST00000377316 2868 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 FCMR-202ENST00000442471 1441 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 CECR2-202ENST00000342247 6178 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 RPRM-201ENST00000325926 1471 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AC004890.2-202ENST00000463462 1494 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PRRT1-202ENST00000375150 1726 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 LAMC3-202ENST00000361069 6133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AP002433.1-201ENST00000525548 964 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 SIVA1-207ENST00000556195 674 ntTSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AP005263.1-201ENST00000579126 914 ntTSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PDCD5-207ENST00000590247 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PLCB2-204ENST00000557821 4517 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 SRMS-201ENST00000217188 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AC139491.1-201ENST00000512675 1516 ntTSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P3-201ENST00000519669 1449 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 KRT8P9-201ENST00000558927 1449 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 ZIC4-209ENST00000473123 1481 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 NKX2-1-203ENST00000518149 2583 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 AC026412.1-201ENST00000507290 1033 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
NIPAL4Q0D2K0 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.2 ms