Protein–RNA interactions for Protein: Q08623

PUDP, Pseudouridine-5'-phosphatase, humanhuman

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PUDPQ08623 WIPF1-202ENST00000359761 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 HTR7P1-201ENST00000538670 1336 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SYNDIG1L-201ENST00000331628 2607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 WDR90-215ENST00000549091 5589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 TSC22D4-202ENST00000393991 1469 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 NLGN2-201ENST00000302926 4642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 TEAD2-202ENST00000377214 2440 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SLK-202ENST00000369755 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 BOLA1-203ENST00000369153 1096 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 F8A2-201ENST00000369505 1116 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 RAB29-203ENST00000414729 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AL353807.1-201ENST00000427475 662 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 NME6-209ENST00000442597 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AL359399.1-201ENST00000557610 462 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 FXYD3-214ENST00000605677 633 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AL353708.3-201ENST00000610272 989 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AL445675.2-201ENST00000620291 557 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ZCCHC24-202ENST00000372336 4933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AGPAT3-201ENST00000291572 5546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 P2RX3-204ENST00000616487 1346 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 TRAM1L1-201ENST00000310754 2023 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 MB21D1-202ENST00000370318 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 C21orf58-205ENST00000397683 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 LINC01586-201ENST00000506090 1840 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 FP475955.4-201ENST00000623131 1990 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 FAM208B-201ENST00000328090 8626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 GPR142-201ENST00000335666 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SPSB1-203ENST00000377399 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 TSPY21P-201ENST00000433481 731 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 STK24-AS1-201ENST00000434547 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AC073050.1-201ENST00000442316 462 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 MAGI2-AS3-211ENST00000451809 707 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ATPAF2-206ENST00000474627 1564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 FAM213B-215ENST00000537325 1096 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 C17orf62-238ENST00000585064 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AC005906.2-207ENST00000639005 1580 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SLC35B2-205ENST00000538577 1909 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 MBIP-203ENST00000416007 1648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 PTCH1-201ENST00000331920 8057 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 AL049812.1-201ENST00000432563 2267 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ARHGEF28-214ENST00000545377 6351 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 KMT5B-203ENST00000401547 2666 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ABCC6-209ENST00000640696 1893 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 RAB7A-201ENST00000265062 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 VMAC-201ENST00000339485 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 GTF2IP1-210ENST00000622829 3605 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 C7orf50-201ENST00000357429 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 SMG1P1-207ENST00000446662 852 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 TNFRSF18-204ENST00000486728 727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 PTTG1-205ENST00000520452 895 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 PRORSD1P-203ENST00000579162 626 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
PUDPQ08623 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.7 ms