Protein–RNA interactions for Protein: Q08050

FOXM1, Forkhead box protein M1, humanhuman

Predictions only

Length 763 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXM1Q08050 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AC006333.2-201ENST00000607957 2099 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 LRRC4B-202ENST00000599957 3019 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.58■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SIX5-201ENST00000317578 3318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 KRT8P8-201ENST00000434750 1448 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 EPHX1-201ENST00000272167 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PRDM8-202ENST00000415738 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CFAP77-203ENST00000393216 1638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SELENOF-203ENST00000401030 727 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CHAC1-203ENST00000487220 853 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AC087498.1-201ENST00000572493 945 ntAPPRIS P1 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PRR29-205ENST00000579184 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SMIM8-209ENST00000608868 815 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SLC29A2-201ENST00000311161 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ZNF839-202ENST00000442396 2987 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 GRM5-201ENST00000305432 4475 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 LGALS9C-209ENST00000581545 1378 ntTSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PHLDB3-201ENST00000292140 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PSKH2-201ENST00000276616 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CAB39-203ENST00000410084 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PALM3-201ENST00000340790 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SLC16A3-222ENST00000619321 2015 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CHST2-201ENST00000309575 4582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ZNF584-202ENST00000322834 1042 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 RXFP4-201ENST00000368318 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 MAP1LC3A-203ENST00000397709 698 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SLC25A3P1-201ENST00000443844 931 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AC130371.2-201ENST00000619443 611 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ST3GAL4-203ENST00000392669 1724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 MCIDAS-201ENST00000513312 1736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 C1orf198-201ENST00000366663 3858 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 MTX1-201ENST00000316721 1441 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PTGER3-209ENST00000460330 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SLC9A6-202ENST00000370698 4631 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 MTSS1L-204ENST00000616026 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ZNF385C-201ENST00000436535 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SGCE-207ENST00000447873 1597 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 KXD1-203ENST00000540691 1592 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SLC2A11-204ENST00000398356 2388 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 EML3-217ENST00000531557 2509 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 MORF4L1-215ENST00000559345 1468 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 TMEM91-209ENST00000539627 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 PSMD3-201ENST00000264639 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 MICU2-201ENST00000382374 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 FGF17-201ENST00000359441 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 MARK2-201ENST00000350490 2903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 TEX21P-204ENST00000641479 1693 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 SLC16A3-221ENST00000617373 2048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 BPIFB3-201ENST00000375494 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 GMPPA-213ENST00000622191 1473 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
FOXM1Q08050 KRT16-201ENST00000301653 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.2 ms