Protein–RNA interactions for Protein: Q07343

PDE4B, cAMP-specific 3',5'-cyclic phosphodiesterase 4B, humanhuman

Predictions only

Length 736 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE4BQ07343 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 ZFP69-202ENST00000372706 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 SCARB1-201ENST00000261693 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 NAPRT-203ENST00000435154 1877 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 DDX59-201ENST00000331314 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 TCIRG1-213ENST00000532635 2457 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 PTCRA-201ENST00000304672 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 HRAS-201ENST00000311189 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 PTCRA-202ENST00000441198 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 PTCRA-203ENST00000446507 759 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 CMTM3-210ENST00000565666 769 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 UBE2K-203ENST00000445950 2175 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AP003356.1-202ENST00000517910 2770 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AP000523.1-201ENST00000398242 1049 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 CIRBP-201ENST00000320936 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 CIRBP-207ENST00000586472 1303 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 PON1-201ENST00000222381 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PDE4BQ07343 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 SMAD7-201ENST00000262158 3087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AC009947.2-201ENST00000444014 672 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 ATP6V0A2-201ENST00000330342 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 ARFRP1-208ENST00000612256 2974 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 DNAJC8-201ENST00000263697 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 CASKIN1-201ENST00000343516 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 PAIP1-201ENST00000306846 2782 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 SUV39H2-204ENST00000378325 1292 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 NT5C-210ENST00000582160 860 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 BST1-201ENST00000265016 1480 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 ATF5-201ENST00000423777 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 PTPRK-218ENST00000525459 1722 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 KLF16-201ENST00000250916 2890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 ALG9-214ENST00000614444 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PDE4BQ07343 KHDC1-202ENST00000370384 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.1 ms