Protein–RNA interactions for Protein: Q05586

GRIN1, Glutamate receptor ionotropic, NMDA 1, humanhuman

Predictions only

Length 938 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GRIN1Q05586 DLGAP4-201ENST00000339266 5016 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
GRIN1Q05586 LRRC23-201ENST00000007969 1615 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
GRIN1Q05586 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 RGS3-231ENST00000613049 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 DKK3-203ENST00000525493 1326 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 ACAA1-209ENST00000450296 1570 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 TMEM234-203ENST00000373593 1411 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 IMMP2L-201ENST00000331762 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 RAP1B-203ENST00000378985 1017 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 RAMP1-204ENST00000409726 734 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 SGO1-AS1-202ENST00000448208 819 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 RAP1B-221ENST00000540209 1264 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 BX649632.1-201ENST00000610187 819 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 PDXK-219ENST00000621478 1967 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 GRIN1-208ENST00000371561 5149 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
GRIN1Q05586 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 STRN4-202ENST00000391910 3628 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 PRDM14-201ENST00000276594 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AC093752.1-201ENST00000511950 605 ntTSL 4 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 KLHL26-205ENST00000599006 989 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 FAM213B-201ENST00000378424 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 PAQR6-201ENST00000292291 1908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 FOXI3-201ENST00000428390 2804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 CNOT11-201ENST00000289382 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 RBM42-201ENST00000262633 1680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 MTMR12-201ENST00000264934 2215 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
GRIN1Q05586 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 SLC5A10-203ENST00000395645 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 TMEM91-210ENST00000542945 1610 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 GBGT1-208ENST00000540636 1934 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 DAB1-202ENST00000371230 1150 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AC007040.1-201ENST00000416229 477 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 TSPY7P-201ENST00000431358 1114 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 TSPY1-202ENST00000451548 1160 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AC008550.1-201ENST00000511500 884 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 LINC02167-201ENST00000562769 594 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 RPS6KA1-204ENST00000374168 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 CCSAP-203ENST00000366687 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AHCYL1-203ENST00000393614 4313 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AC114490.1-202ENST00000311990 1887 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
GRIN1Q05586 PER3-203ENST00000377541 1524 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 ZNF655-202ENST00000320583 1601 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AC138028.1-201ENST00000333666 2137 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 KMT2B-201ENST00000420124 8469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 RELL2-202ENST00000444782 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AC096733.2-201ENST00000609937 1394 ntBASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 FUOM-203ENST00000368552 762 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AL390728.5-201ENST00000428687 706 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 USP46-AS1-201ENST00000503051 1048 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 AC016737.2-201ENST00000609273 358 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 KANK3-205ENST00000610351 1191 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
GRIN1Q05586 ADORA1-202ENST00000337894 2919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms