Protein–RNA interactions for Protein: Q04900

CD164, Sialomucin core protein 24, humanhuman

Predictions only

Length 197 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CD164Q04900 ITGB7-209ENST00000550743 2138 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TRABD-203ENST00000395827 2172 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CYTH1-209ENST00000589296 2159 ntTSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 DMRT2-204ENST00000382251 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.23□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TDRP-201ENST00000324079 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PYURF-201ENST00000273968 1361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 GPER1-201ENST00000297469 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AL512625.1-201ENST00000305709 2541 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CCDC106-201ENST00000308964 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PLPBP-201ENST00000328195 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CEACAM3-201ENST00000344550 1022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PTGER3-203ENST00000354608 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 RENBP-201ENST00000369997 1322 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 RUFY1-202ENST00000393438 2454 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 DTWD1-202ENST00000403028 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC079145.1-201ENST00000416575 541 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 COMMD7-202ENST00000446419 1343 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TTTY14-205ENST00000454875 544 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 C1orf52-203ENST00000471115 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 DBNL-219ENST00000490734 2004 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SOX15-202ENST00000538513 1050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 WWOX-205ENST00000539474 1670 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 NOL3-204ENST00000564053 1592 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FAM219B-212ENST00000565772 1249 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AL161938.1-201ENST00000569833 2180 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SOX15-203ENST00000570788 1093 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FARSA-207ENST00000588025 2057 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FXYD1-204ENST00000588081 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 WT1-AS_3.1-201ENST00000613262 234 ntBASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FAM53A-207ENST00000489363 2776 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC11.22□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CABIN1-202ENST00000337989 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CBX1-202ENST00000393408 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TREX2-203ENST00000338525 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 NUDT15-201ENST00000258662 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 PDLIM2-204ENST00000397760 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 IRX1P1-201ENST00000438849 1838 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC124283.5-201ENST00000624661 1809 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FEM1AP3-201ENST00000403722 1741 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TSPAN15-201ENST00000373290 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FDFT1-209ENST00000525900 1596 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 RAB33B-201ENST00000305626 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 UBE2E1-201ENST00000306627 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 GPR20-201ENST00000377741 1515 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 HSPB2-C11orf52-202ENST00000534100 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AGER-207ENST00000375076 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 HIGD1A-201ENST00000321331 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 DNM1-206ENST00000475805 2710 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 FKBP2-202ENST00000394540 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 YBEY-205ENST00000397694 534 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 NCBP2-207ENST00000452404 1133 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC092849.2-201ENST00000492523 333 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 ZNF696-204ENST00000520333 605 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AF274858.3-202ENST00000569906 755 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 AC004264.1-201ENST00000608354 794 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 KMT2E-207ENST00000476671 2523 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
CD164Q04900 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CD164Q04900 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CD164Q04900 YY1AP1-210ENST00000368339 3073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CD164Q04900 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CD164Q04900 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.62
CD164Q04900 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CD164Q04900 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AL031282.2-201ENST00000598846 5079 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
CD164Q04900 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms